要将呼吸机出口到欧盟并进行认证，您需要办理欧盟的医疗器械CE认证，符合新的医疗器械法规（Medical Device Regulation，MDR）要求。以下是一般的办理步骤：

1、确定产品分类：根据呼吸机的特性和用途，确定其在欧盟的医疗器械分类。MDR将医疗器械分为四个风险类别：I类、IIa类、IIb类和III类。

2、准备技术文件：根据MDR的要求，您需要准备一系列技术文件，包括但不限于以下内容：

设计和制造信息：包括产品规格、制造过程、材料成分等。

性能评估报告：包括产品性能测试结果和数据分析。

临床评价报告：提供与产品安全性和有效性相关的临床数据。

标签和说明书：提供产品标签、使用说明书等相关信息。

质量管理体系文件：包括质量手册、程序文件、培训记录等，以证明您的公司具有良好的质量管理体系。

3、选择认证机构：根据MDR的要求，您需要选择一家获得认可的认证机构（通常称为公告机构）进行技术评审和审核。与认证机构联系，并了解其要求和程序。

4、提交申请和技术文件：将准备好的申请和技术文件提交给选择的认证机构。认证机构将对您的文件进行评估和审核，并进行现场检查（如果需要）。

5、进行技术评审和审核：认证机构将对您的技术文件进行评审和审核，并根据MDR的要求进行技术评估。

6、颁发CE认证：如果您的技术文件符合MDR的要求并通过认证机构的审核，他们将颁发医疗器械CE认证，并将您的产品注册在欧盟的相关数据库中。

请注意，具体的CE MDR认证办理流程可能因个人情况和认证机构的要求而有所不同。建议您与选择的认证机构联系，获取最新的指导和要求，并遵循其指导进行办理。同时，确保您的技术文件和相关文件完整、准确，并符合MDR的要求。