要将呼吸机出口到日本并进行认证，您需要办理日本医疗器械和药品管理局（Pharmaceuticals and Medical Devices Agency，PMDA）的医疗器械认证。以下是一般的办理步骤：

1、准备申请材料：您需要准备一系列文件和信息，包括但不限于以下内容：

产品信息：包括呼吸机的技术规格、用途、材料成分等详细信息。

制造过程和质量管理体系：提供有关产品的制造过程、质量管理体系和质量控制措施的信息。

性能和安全性评价：包括产品性能测试结果、安全性评估报告等。

临床试验数据（如果适用）：提供与产品安全性和有效性相关的临床试验数据。

标签和说明书：提供产品标签、使用说明书等相关信息。

2、选择认证机构：根据PMDA的要求，您需要选择一家获得认可的认证机构进行技术评审和审核。与认证机构联系，并了解其要求和程序。

3、提交注册申请：将准备好的注册申请材料提交给选择的认证机构。他们将对您的申请进行评估和审核，并提供技术评审报告。

4、提交注册申请到PMDA：将认证机构提供的技术评审报告和其他申请材料一起，提交给PMDA进行注册申请。

5、审核和审批：PMDA将对您的注册申请进行审核和审批。他们可能会要求补充材料或进行现场检查，以核实您的产品符合性和质量管理体系。

6、获得认证：如果您的注册申请获得批准并符合PMDA的要求，他们将颁发医疗器械认证，并将您的产品注册在日本的相关数据库中。

请注意，具体的PMDA认证办理流程可能因个人情况和认证机构的要求而有所不同。建议您与选择的认证机构和PMDA联系，获取最新的指导和要求，并遵循其指导进行办理。同时，确保您的申请材料和相关文件完整、准确，并符合PMDA的要求。